A Cientec originou-se em 1997, fruto do espírito empreendedor de pesquisadores do Dep. de Eng. Agrícola da UFV que ganhava destaque dentro de uma instituição até então conservadora. Foi a primeira empresa incubada na UFV. Graduou-se pela Incubadora de Empresas de Base Tecnológica - CENTEV/UFV em 1999, focada em oferecer consultoria e software para a área de irrigação.

No ano de 2000, a empresa é transferida para novos sócios, jovens recém graduados em Ciência da Computação pela UFV que, através de suas visões empreendedoras, definem um modelo de negócio diferenciado que acredita na transferência das pesquisas científicas para o mercado através da tecnologia da informação.

Em 2001 surgem os primeiros softwares iniciados sob a nova administração. O Mata Nativa (sistema para análise fitossociológica e elaboração de inventários e planos de manejo de florestas nativas) e o Aspersor (sistema para elaboração de projetos de irrigação por aspersão).

Ainda em 2001, levando tecnologia ao campo, inicia a prestação de serviços para o SEBRAE MG, através do programa EDUCAMPO, com sistemas de controle de custo da produção leiteira, cafeeira e cana-de-açúcar.

Em 2002, primando pela qualidade nos serviços e produtos, a empresa inicia a implantação do Programa Sebrae de Qualidade Total. Muda sua sede física, passando para um espaço mais amplo e próximo à UFV, sua principal parceira.

No mesmo ano, inicia trabalhos para o ONS - Operador Nacional do Sistema Elétrico e ANA - Agência Nacional de Águas, com um sistema que orienta as duas instituições no estabelecimento de políticas de uso e consumo da água para diversos usos nas diversas bacias hidrográficas brasileiras.

Submete, ainda, diversos projetos em instituições de fomento a pesquisa e desenvolvimento tecnológico, obtendo sucesso de aprovação em projetos na FINEP, FAPEMIG e CNPq.

Em 2005, a Cientec passa a contar com sua sede própria, garantindo maior estabilidade e permitindo investir cada vez mais na melhoria do ambiente de trabalho.

Em janeiro de 2006, lança a versão 2 do software Mata Nativa, conseguindo uma marca de ter clientes do software em todos os estados brasileiros e estar presente nas principais universidades do país.

Em junho de 2006, a empresa é homenageada pela Incubadora CENTEV/UFV, como Empresa Destaque 2006 por seu desempenho, sucesso, inovação e empreendedorismo.

Também em 2006, através de seus diretores, assume um importante papel no desenvolvimento da TI em Viçosa e região. É uma das empresas líderes no movimento de implantação do Arranjo Produtivo Local de Tecnologia da Informação de Viçosa – APL TI Viçosa. Seu diretor assume a presidência deste importante APL TI, que é reconhecido pelo Governo de Minas como o segundo pólo de TI do estado e o primeiro em TI aplicada ao agronegócio e recursos naturais.

Em 2007, amplia seu programa de qualidade e conquista outra certificação do Programa SEBRAE de Gestão da Qualidade. Implanta dois programas internos focados em seus colaboradores: Responsabilidade Sócio-Ambiental e Qualidade de Vida.

Em 2008 realiza seus primeiros negócios internacionais. O software Mata Nativa foi comercializado para uma empresa alemã e também para a Universidade de Lisboa, que adquiriu o software e um curso de capacitação, realizado em Lisboa. A partir destas iniciativas, a Cientec buscou parcerias e recebeu o certificado IBEROEKA para, junto com uma empresa portuguesa, ampliar o Mata Nativa para atender todas as demandas européias de inventário florestal.

Em 2009, inicia um grande passo para a empresa na busca pela ampliação da sua atuação. Iniciou seu processo para a certificação MPS.BR, programa brasileiro de qualificação e certificação em desenvolvimento de software. Além disso, conquistou sua participação no programa do IEL para capacitação das empresas para a internacionalização. Com estes programas e um plano de negócios renovado e audacioso, a Cientec inicia sua fase de expansão para ampliar sua atuação no mercado nacional e alçar vôos no mercado internacional.